Kompleksy białkowe

Powtarzalna i precyzyjna analiza kompleksów białko-białko, białko-kwasy nukleinowe, białko-membrany oraz konformerów przestrzennych RNA i ssDNA metodami elektroforezy natywnej.

Oddziaływania białko-białko oraz białko-kwasy nukleinowe mają istotny wpływ na funkcjonowanie większości procesów biologicznych. Około 80% ludzkich białek tworzy kompleksy z innymi białkami. Szeroka gama metod analizy kompleksów białko-białko oraz białko-kwasy nukleinowe obejmuje metody in silico (Rys.1) , in vivo oraz in vitro.

Istotnym elementem wpływającym na wybór metody analizy kompleksów in vitro jest możliwość odtworzenia w jej czasie warunków zbliżonych w jak największym stopniu do naturalnych warunków fizyko-chemicznych występowania badanego kompleksu.

Do jednych z częściej stosowanych metod analizy kompleksów in vitro należą metody oparte o elektroforezę natywną, które łączą w sobie funkcje analityczne i preparatywne i pozwalają dzięki temu na dalszą charakterystykę rozdzielonych w warunkach natywnych składników kompleksów np. metodami spektrometrii masowej, NMR, cryo-EM lub oznaczanie ich aktywności enzymatycznej/biologicznej.

Do analizy kompleksów białko-białko najczęściej stosuje się metodę BlueNative a kompleksów białko-kwasy nukleinowe metodę EMSA. W celu zwiększenia rozdzielczości tych metod opracowano ich wersje 2D które pozwalają na identyfikacje pojedynczych składniki kompleksów.

Zapewnieni powtarzalności tych analiz wymaga standaryzacji sposobu przygotowania żeli polikarylamidowych (polecamy nasz Poradnik pt "Jak powtarzalnie spolimeryzować żel poliakrylamidowy") oraz odpowiedniej jakości odczynników chemicznych. Polecamy szeroką game dedykowanych odczynników do przygotowania, przeprowadzenia oraz wizualizacji białek w żelach poliakrylamidowych w pełni kompatybilnych z dalszą ich analizą np metodami spektrometrii masowej.

Nie bez znaczenie jest też zapewnienie powtarzalnych warunków elektroforezy natywnej. Oferujemy unikalny w skali świata, sprzęt DNAPointer(R) System (Rys . 2)

Rysunek 1 Analiza struktury 3D kompleksów białko-memebrana metodami cryo-EM wymaga

bardzo wysokiej jakości (jednorodności) analizowanego preparatu. Metody

natywnej elektroforezy kompleksów białko-membrana pozwalają uzyskać pod-frakcje

kompleksów różniące się nie tylko ich składem, ale także konformacją przestrzenną.

Parametry techniczne DNAPointer System v 6.0
Zakres stablizacji temperatur żelu 2 - 65°C Nastawa temperatury co 0,1°C
Jednorodność temperatury żelu 0,2°C
Maksymalna liczba prób 34
Parametry techniczne:
Napięcie (max.) 3000 V
Natężenie prądu (max.) 300 mA
Moc urządzenia 600 W
Wymiary (sz x gł x wys) 350 x 420 x 380 mm
Waga 22 kg
Zasilanie 230 V/50 Hz

DNAPointer ® System v 6.0

stabilizuje temperature żelu/prób w czasie elektroforezy na poziomie 0,2°C co w czsie antywnych rozdziałów np typu BlueNative lub EMSA zapewnia:

98% powtarzalność rozdiałów (EMSA, BlueNative, etc)
skrócony do 20% czas analizy w stosunku do klasycznych apratów do elektroforezy płytowej pozwla miedzy innymi na analizę stechiometrii i kinetyki powstawania kompleksów
optymalizacje temperatury analizy w zakresie od 4C do 65C

Metoda ta dzięki połączeniu analitycznej i preparatywnej funkcji w czasie jednego rozdziału kompleksów białkowych/ kw.nukleinowych umożliwia dalszą ich charakterytykę metodami takimi jak:

zymogramy - aktywność enzymatyczna
immunodetekcję białek np. metodą np Western blotting
spektrometria masowa, spektroskopii magnetycznego rezonansu jądrowego (NMR)
mrożonej mikroskopii elektronowej (Cryo-EM)

Zamawianie

Nr kat Opis Parametry użytkowe

105-100

DNA Pointer® System v 6.0

- cyfrowy zasilacz wysokonapięciowy do 3000V;

- termodynamiczny układ chłodzący na ogniwach Peltiera,

stabilizujący temperaturę żelu w zakresie 4 - 65 st. C / 0,1 st.C

- komora elektroforetyczną : szyby o wymiarach 210 x 170 mm.

- jednostka sterująca z ekranem dotykowym zapewnia

programowanie oraz odczyt warunków elektroforezy

w czasie rzeczywistym. Oprogramowanie pozwala użytkownikowi:

zapisywać profile elektroforez za pomocą gotowych szablonów dla

każdego rodzaju elektroforezy (MSSCP, EMSA, BlueNative ),

Dowolnie programować parametry elektroforezy (temperaturę,

napięcie, moc, czas). Program posiada funkcję Gel Saver,

pozwalającą na zachowanie wysokiej jakości rozdziału po

zakończeniu elektroforezy.

Zapraszamy do kontaktu za pośrednictwem poniższego formularza w celu szybkiego uzyskania aktualnej oferty cenowej oraz informacji nt. zastosowań DNAPointer System do analizy konformerów przestrzennych kwasów nukleinowych (RNA, ssDNA), kompleksów białko- białko, białko-kwasy nukleinowe oraz białko-membrany a także detekcji i odkrywania mniejszościowych wariantów genetycznych w niejednorodnych próbach klinicznych i biologicznych (np biopsje z guzów litych, wirusy RNA)

Wyposażenie i akcesoria

105-100	DNA Pointer System v 6.0
105-111	Przekładki DNA Pointer 0,5 mm (2 szt)
105-112	Przekładki DNAPointer 1,0 mm (2 szt)
105-113	Przekładki DNAPointer 1,5 mm (2 szt)
105-114	Przekładki DNAPointer 2,0 mm (2 szt)
105-120	Grzebień DNAPointer 0,25mm/20 studzienek
105-121	Grzebień DNAPointer 0,5 mm/20 studzienek
105-122	Grzebień DNAPointer 0,5 mm/24 studzienek
105-123	Grzebień DNAPointer 0,5 mm/33 studzienek
105-124	Grzebień DNAPointer 0,5 mm/44 studzienek
105-125	Grzebień DNAPointer 1,0 mm/20 studzienek
105-126	Grzebień DNAPointer 1,0 mm/24 studzienki
105-127	Grzebień DNAPointer 1,0 mm/33 studzienki
105-128	Grzebień DNAPointer 1,0 mm/44 studzienki
105-129	Grzebień DNAPointer 1,0 mm/17 studzienki
105-130	Uszczelka U-kształtna DNAPointer 0,5 mm
105-131	Uszczelka U-kształtna DNAPointer 1,0 mm
105-132	Uszczelka U-kształtna DNAPointer 1,5 mm
105-133	Uszczelka U-kształtna DNAPointer 2,0 mm
105-134	Uszczelka U-kształtna DNAPointer 0,5 (26*16) mm
105-150	Szyby do zastawu DNAPointer v.4 (1 kpl = 2 szt) 24x19
105-151	Szyby do zastawu DNAPointer v.6 (1 kpl = 2 szt) 21x17
105-161	Multipol Zestaw DNAPointer v.6
105-162	Folia przekładkowa do Zest. Multipol (10 szt)
105-163	Wypełnienie MULTIPOL DNA 10 mm 19x19
105-171	Statyw do suszenia szyb DNAPointer
105-191	Zestaw Dryout do suszenia żeli PA DNAPointer v. 6.0
105-192	Folia do zest. DRYOUT DNAPointer (35 żeli)
105-193	Folia do zest. DRYOUT DNAPointer (100 żeli)
105-200	Oprogramowanie DNA Pointer System